Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB2

KRT84, Keratin, type II cuticular Hb4, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT84Q9NSB2 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT84Q9NSB2 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT84Q9NSB2 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms