Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
A4GALTQ9NPC4 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
A4GALTQ9NPC4 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
A4GALTQ9NPC4 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
A4GALTQ9NPC4 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
A4GALTQ9NPC4 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
A4GALTQ9NPC4 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
A4GALTQ9NPC4 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
A4GALTQ9NPC4 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
A4GALTQ9NPC4 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
A4GALTQ9NPC4 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
A4GALTQ9NPC4 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
A4GALTQ9NPC4 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
A4GALTQ9NPC4 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
A4GALTQ9NPC4 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
A4GALTQ9NPC4 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
A4GALTQ9NPC4 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
A4GALTQ9NPC4 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
A4GALTQ9NPC4 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
A4GALTQ9NPC4 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
A4GALTQ9NPC4 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
A4GALTQ9NPC4 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
A4GALTQ9NPC4 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
A4GALTQ9NPC4 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
A4GALTQ9NPC4 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
A4GALTQ9NPC4 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
A4GALTQ9NPC4 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
A4GALTQ9NPC4 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
A4GALTQ9NPC4 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
A4GALTQ9NPC4 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
A4GALTQ9NPC4 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
A4GALTQ9NPC4 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
A4GALTQ9NPC4 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
A4GALTQ9NPC4 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
A4GALTQ9NPC4 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
A4GALTQ9NPC4 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
A4GALTQ9NPC4 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
A4GALTQ9NPC4 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
A4GALTQ9NPC4 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
A4GALTQ9NPC4 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
A4GALTQ9NPC4 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
A4GALTQ9NPC4 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
A4GALTQ9NPC4 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
A4GALTQ9NPC4 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
A4GALTQ9NPC4 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
A4GALTQ9NPC4 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
A4GALTQ9NPC4 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
A4GALTQ9NPC4 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
A4GALTQ9NPC4 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
A4GALTQ9NPC4 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
A4GALTQ9NPC4 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
A4GALTQ9NPC4 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
A4GALTQ9NPC4 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
A4GALTQ9NPC4 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
A4GALTQ9NPC4 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
A4GALTQ9NPC4 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
A4GALTQ9NPC4 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
A4GALTQ9NPC4 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
A4GALTQ9NPC4 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
A4GALTQ9NPC4 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
A4GALTQ9NPC4 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
A4GALTQ9NPC4 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
A4GALTQ9NPC4 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
A4GALTQ9NPC4 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
A4GALTQ9NPC4 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
A4GALTQ9NPC4 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
A4GALTQ9NPC4 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
A4GALTQ9NPC4 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
A4GALTQ9NPC4 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
A4GALTQ9NPC4 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
A4GALTQ9NPC4 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
A4GALTQ9NPC4 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
A4GALTQ9NPC4 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
A4GALTQ9NPC4 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
A4GALTQ9NPC4 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
A4GALTQ9NPC4 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
A4GALTQ9NPC4 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
A4GALTQ9NPC4 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
A4GALTQ9NPC4 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
A4GALTQ9NPC4 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
A4GALTQ9NPC4 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
A4GALTQ9NPC4 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
A4GALTQ9NPC4 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
A4GALTQ9NPC4 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
A4GALTQ9NPC4 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
A4GALTQ9NPC4 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
A4GALTQ9NPC4 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
A4GALTQ9NPC4 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
A4GALTQ9NPC4 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
A4GALTQ9NPC4 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
A4GALTQ9NPC4 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
A4GALTQ9NPC4 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
A4GALTQ9NPC4 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
A4GALTQ9NPC4 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
A4GALTQ9NPC4 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
A4GALTQ9NPC4 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
A4GALTQ9NPC4 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
A4GALTQ9NPC4 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
A4GALTQ9NPC4 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
A4GALTQ9NPC4 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms