Protein–RNA interactions for Protein: Q9HDB9

ERVK-5, Endogenous retrovirus group K member 5 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-5Q9HDB9 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ERVK-5Q9HDB9 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ERVK-5Q9HDB9 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ERVK-5Q9HDB9 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ERVK-5Q9HDB9 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ERVK-5Q9HDB9 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ERVK-5Q9HDB9 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ERVK-5Q9HDB9 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ERVK-5Q9HDB9 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ERVK-5Q9HDB9 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ERVK-5Q9HDB9 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ERVK-5Q9HDB9 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ERVK-5Q9HDB9 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ERVK-5Q9HDB9 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
ERVK-5Q9HDB9 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ERVK-5Q9HDB9 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ERVK-5Q9HDB9 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ERVK-5Q9HDB9 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ERVK-5Q9HDB9 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ERVK-5Q9HDB9 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ERVK-5Q9HDB9 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ERVK-5Q9HDB9 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ERVK-5Q9HDB9 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
ERVK-5Q9HDB9 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ERVK-5Q9HDB9 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ERVK-5Q9HDB9 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ERVK-5Q9HDB9 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ERVK-5Q9HDB9 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ERVK-5Q9HDB9 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ERVK-5Q9HDB9 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ERVK-5Q9HDB9 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ERVK-5Q9HDB9 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ERVK-5Q9HDB9 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ERVK-5Q9HDB9 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
ERVK-5Q9HDB9 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ERVK-5Q9HDB9 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ERVK-5Q9HDB9 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ERVK-5Q9HDB9 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ERVK-5Q9HDB9 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ERVK-5Q9HDB9 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ERVK-5Q9HDB9 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ERVK-5Q9HDB9 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ERVK-5Q9HDB9 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ERVK-5Q9HDB9 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ERVK-5Q9HDB9 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ERVK-5Q9HDB9 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ERVK-5Q9HDB9 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
ERVK-5Q9HDB9 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ERVK-5Q9HDB9 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ERVK-5Q9HDB9 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ERVK-5Q9HDB9 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ERVK-5Q9HDB9 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ERVK-5Q9HDB9 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ERVK-5Q9HDB9 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ERVK-5Q9HDB9 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ERVK-5Q9HDB9 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ERVK-5Q9HDB9 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ERVK-5Q9HDB9 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ERVK-5Q9HDB9 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ERVK-5Q9HDB9 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ERVK-5Q9HDB9 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ERVK-5Q9HDB9 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ERVK-5Q9HDB9 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ERVK-5Q9HDB9 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ERVK-5Q9HDB9 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ERVK-5Q9HDB9 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ERVK-5Q9HDB9 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ERVK-5Q9HDB9 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ERVK-5Q9HDB9 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ERVK-5Q9HDB9 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ERVK-5Q9HDB9 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ERVK-5Q9HDB9 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ERVK-5Q9HDB9 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ERVK-5Q9HDB9 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ERVK-5Q9HDB9 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ERVK-5Q9HDB9 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ERVK-5Q9HDB9 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ERVK-5Q9HDB9 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ERVK-5Q9HDB9 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ERVK-5Q9HDB9 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ERVK-5Q9HDB9 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ERVK-5Q9HDB9 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ERVK-5Q9HDB9 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
ERVK-5Q9HDB9 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ERVK-5Q9HDB9 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ERVK-5Q9HDB9 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ERVK-5Q9HDB9 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ERVK-5Q9HDB9 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ERVK-5Q9HDB9 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ERVK-5Q9HDB9 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ERVK-5Q9HDB9 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ERVK-5Q9HDB9 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ERVK-5Q9HDB9 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ERVK-5Q9HDB9 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ERVK-5Q9HDB9 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ERVK-5Q9HDB9 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ERVK-5Q9HDB9 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ERVK-5Q9HDB9 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ERVK-5Q9HDB9 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ERVK-5Q9HDB9 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms