Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ8

TMEM27, Collectrin, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM27Q9HBJ8 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMEM27Q9HBJ8 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMEM27Q9HBJ8 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMEM27Q9HBJ8 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMEM27Q9HBJ8 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMEM27Q9HBJ8 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMEM27Q9HBJ8 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms