Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D0

CLSTN2, Calsyntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN2Q9H4D0 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
CLSTN2Q9H4D0 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
CLSTN2Q9H4D0 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
CLSTN2Q9H4D0 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CLSTN2Q9H4D0 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CLSTN2Q9H4D0 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CLSTN2Q9H4D0 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CLSTN2Q9H4D0 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CLSTN2Q9H4D0 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CLSTN2Q9H4D0 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CLSTN2Q9H4D0 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLSTN2Q9H4D0 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLSTN2Q9H4D0 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLSTN2Q9H4D0 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLSTN2Q9H4D0 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLSTN2Q9H4D0 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLSTN2Q9H4D0 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLSTN2Q9H4D0 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLSTN2Q9H4D0 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLSTN2Q9H4D0 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLSTN2Q9H4D0 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLSTN2Q9H4D0 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLSTN2Q9H4D0 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLSTN2Q9H4D0 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLSTN2Q9H4D0 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLSTN2Q9H4D0 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLSTN2Q9H4D0 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLSTN2Q9H4D0 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLSTN2Q9H4D0 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLSTN2Q9H4D0 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLSTN2Q9H4D0 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLSTN2Q9H4D0 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLSTN2Q9H4D0 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLSTN2Q9H4D0 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLSTN2Q9H4D0 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLSTN2Q9H4D0 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLSTN2Q9H4D0 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLSTN2Q9H4D0 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLSTN2Q9H4D0 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLSTN2Q9H4D0 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLSTN2Q9H4D0 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLSTN2Q9H4D0 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLSTN2Q9H4D0 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLSTN2Q9H4D0 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLSTN2Q9H4D0 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLSTN2Q9H4D0 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLSTN2Q9H4D0 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLSTN2Q9H4D0 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLSTN2Q9H4D0 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLSTN2Q9H4D0 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLSTN2Q9H4D0 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CLSTN2Q9H4D0 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLSTN2Q9H4D0 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CLSTN2Q9H4D0 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLSTN2Q9H4D0 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLSTN2Q9H4D0 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLSTN2Q9H4D0 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLSTN2Q9H4D0 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLSTN2Q9H4D0 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLSTN2Q9H4D0 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLSTN2Q9H4D0 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLSTN2Q9H4D0 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLSTN2Q9H4D0 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLSTN2Q9H4D0 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLSTN2Q9H4D0 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLSTN2Q9H4D0 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLSTN2Q9H4D0 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLSTN2Q9H4D0 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLSTN2Q9H4D0 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLSTN2Q9H4D0 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CLSTN2Q9H4D0 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLSTN2Q9H4D0 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CLSTN2Q9H4D0 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLSTN2Q9H4D0 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLSTN2Q9H4D0 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CLSTN2Q9H4D0 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CLSTN2Q9H4D0 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLSTN2Q9H4D0 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLSTN2Q9H4D0 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLSTN2Q9H4D0 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLSTN2Q9H4D0 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLSTN2Q9H4D0 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLSTN2Q9H4D0 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLSTN2Q9H4D0 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms