Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CEP44Q9C0F1 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms