Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NLRP1Q9C000 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NLRP1Q9C000 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NLRP1Q9C000 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NLRP1Q9C000 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NLRP1Q9C000 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NLRP1Q9C000 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NLRP1Q9C000 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NLRP1Q9C000 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NLRP1Q9C000 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NLRP1Q9C000 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NLRP1Q9C000 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NLRP1Q9C000 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NLRP1Q9C000 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NLRP1Q9C000 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NLRP1Q9C000 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NLRP1Q9C000 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NLRP1Q9C000 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NLRP1Q9C000 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NLRP1Q9C000 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NLRP1Q9C000 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NLRP1Q9C000 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NLRP1Q9C000 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
NLRP1Q9C000 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NLRP1Q9C000 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NLRP1Q9C000 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NLRP1Q9C000 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NLRP1Q9C000 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NLRP1Q9C000 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
NLRP1Q9C000 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NLRP1Q9C000 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NLRP1Q9C000 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NLRP1Q9C000 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NLRP1Q9C000 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
NLRP1Q9C000 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NLRP1Q9C000 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NLRP1Q9C000 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NLRP1Q9C000 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NLRP1Q9C000 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NLRP1Q9C000 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NLRP1Q9C000 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NLRP1Q9C000 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NLRP1Q9C000 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NLRP1Q9C000 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NLRP1Q9C000 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
NLRP1Q9C000 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
NLRP1Q9C000 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
NLRP1Q9C000 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NLRP1Q9C000 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
NLRP1Q9C000 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
NLRP1Q9C000 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
NLRP1Q9C000 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
NLRP1Q9C000 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
NLRP1Q9C000 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NLRP1Q9C000 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NLRP1Q9C000 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NLRP1Q9C000 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NLRP1Q9C000 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NLRP1Q9C000 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NLRP1Q9C000 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NLRP1Q9C000 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
NLRP1Q9C000 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NLRP1Q9C000 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
NLRP1Q9C000 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NLRP1Q9C000 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NLRP1Q9C000 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NLRP1Q9C000 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NLRP1Q9C000 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NLRP1Q9C000 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
NLRP1Q9C000 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NLRP1Q9C000 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NLRP1Q9C000 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NLRP1Q9C000 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NLRP1Q9C000 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NLRP1Q9C000 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NLRP1Q9C000 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NLRP1Q9C000 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NLRP1Q9C000 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
NLRP1Q9C000 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NLRP1Q9C000 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NLRP1Q9C000 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
NLRP1Q9C000 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NLRP1Q9C000 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NLRP1Q9C000 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NLRP1Q9C000 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NLRP1Q9C000 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NLRP1Q9C000 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NLRP1Q9C000 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NLRP1Q9C000 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NLRP1Q9C000 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NLRP1Q9C000 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NLRP1Q9C000 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NLRP1Q9C000 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NLRP1Q9C000 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NLRP1Q9C000 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NLRP1Q9C000 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NLRP1Q9C000 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NLRP1Q9C000 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NLRP1Q9C000 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NLRP1Q9C000 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms