Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXY4

RSPO3, R-spondin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPO3Q9BXY4 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RSPO3Q9BXY4 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms