Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RNF17Q9BXT8 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RNF17Q9BXT8 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RNF17Q9BXT8 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RNF17Q9BXT8 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RNF17Q9BXT8 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RNF17Q9BXT8 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RNF17Q9BXT8 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RNF17Q9BXT8 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RNF17Q9BXT8 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RNF17Q9BXT8 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RNF17Q9BXT8 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RNF17Q9BXT8 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RNF17Q9BXT8 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RNF17Q9BXT8 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RNF17Q9BXT8 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
RNF17Q9BXT8 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RNF17Q9BXT8 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RNF17Q9BXT8 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RNF17Q9BXT8 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RNF17Q9BXT8 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RNF17Q9BXT8 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RNF17Q9BXT8 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RNF17Q9BXT8 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RNF17Q9BXT8 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RNF17Q9BXT8 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RNF17Q9BXT8 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RNF17Q9BXT8 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
RNF17Q9BXT8 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RNF17Q9BXT8 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RNF17Q9BXT8 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
RNF17Q9BXT8 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RNF17Q9BXT8 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
RNF17Q9BXT8 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
RNF17Q9BXT8 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RNF17Q9BXT8 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
RNF17Q9BXT8 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
RNF17Q9BXT8 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.77
RNF17Q9BXT8 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
RNF17Q9BXT8 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
RNF17Q9BXT8 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
RNF17Q9BXT8 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RNF17Q9BXT8 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RNF17Q9BXT8 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RNF17Q9BXT8 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RNF17Q9BXT8 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RNF17Q9BXT8 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RNF17Q9BXT8 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RNF17Q9BXT8 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RNF17Q9BXT8 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RNF17Q9BXT8 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
RNF17Q9BXT8 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RNF17Q9BXT8 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RNF17Q9BXT8 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RNF17Q9BXT8 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
RNF17Q9BXT8 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RNF17Q9BXT8 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RNF17Q9BXT8 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
RNF17Q9BXT8 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RNF17Q9BXT8 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RNF17Q9BXT8 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RNF17Q9BXT8 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RNF17Q9BXT8 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RNF17Q9BXT8 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RNF17Q9BXT8 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RNF17Q9BXT8 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RNF17Q9BXT8 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RNF17Q9BXT8 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RNF17Q9BXT8 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RNF17Q9BXT8 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RNF17Q9BXT8 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RNF17Q9BXT8 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RNF17Q9BXT8 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RNF17Q9BXT8 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
RNF17Q9BXT8 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
RNF17Q9BXT8 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RNF17Q9BXT8 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RNF17Q9BXT8 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RNF17Q9BXT8 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RNF17Q9BXT8 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
RNF17Q9BXT8 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RNF17Q9BXT8 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RNF17Q9BXT8 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RNF17Q9BXT8 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RNF17Q9BXT8 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RNF17Q9BXT8 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RNF17Q9BXT8 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RNF17Q9BXT8 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RNF17Q9BXT8 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RNF17Q9BXT8 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RNF17Q9BXT8 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RNF17Q9BXT8 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RNF17Q9BXT8 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RNF17Q9BXT8 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
RNF17Q9BXT8 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RNF17Q9BXT8 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RNF17Q9BXT8 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RNF17Q9BXT8 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RNF17Q9BXT8 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RNF17Q9BXT8 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms