Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTC8

MTA3, Metastasis-associated protein MTA3, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA3Q9BTC8 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MTA3Q9BTC8 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MTA3Q9BTC8 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MTA3Q9BTC8 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MTA3Q9BTC8 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MTA3Q9BTC8 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MTA3Q9BTC8 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MTA3Q9BTC8 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MTA3Q9BTC8 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MTA3Q9BTC8 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MTA3Q9BTC8 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MTA3Q9BTC8 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MTA3Q9BTC8 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MTA3Q9BTC8 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MTA3Q9BTC8 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MTA3Q9BTC8 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
MTA3Q9BTC8 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MTA3Q9BTC8 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MTA3Q9BTC8 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
MTA3Q9BTC8 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MTA3Q9BTC8 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MTA3Q9BTC8 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MTA3Q9BTC8 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MTA3Q9BTC8 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MTA3Q9BTC8 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
MTA3Q9BTC8 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
MTA3Q9BTC8 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MTA3Q9BTC8 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MTA3Q9BTC8 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MTA3Q9BTC8 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MTA3Q9BTC8 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MTA3Q9BTC8 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MTA3Q9BTC8 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MTA3Q9BTC8 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MTA3Q9BTC8 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MTA3Q9BTC8 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MTA3Q9BTC8 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MTA3Q9BTC8 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MTA3Q9BTC8 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MTA3Q9BTC8 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
MTA3Q9BTC8 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MTA3Q9BTC8 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
MTA3Q9BTC8 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
MTA3Q9BTC8 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MTA3Q9BTC8 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MTA3Q9BTC8 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MTA3Q9BTC8 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
MTA3Q9BTC8 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MTA3Q9BTC8 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MTA3Q9BTC8 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MTA3Q9BTC8 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MTA3Q9BTC8 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MTA3Q9BTC8 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MTA3Q9BTC8 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MTA3Q9BTC8 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MTA3Q9BTC8 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MTA3Q9BTC8 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MTA3Q9BTC8 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MTA3Q9BTC8 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MTA3Q9BTC8 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MTA3Q9BTC8 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MTA3Q9BTC8 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MTA3Q9BTC8 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
MTA3Q9BTC8 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
MTA3Q9BTC8 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
MTA3Q9BTC8 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
MTA3Q9BTC8 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
MTA3Q9BTC8 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.94
MTA3Q9BTC8 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
MTA3Q9BTC8 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
MTA3Q9BTC8 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
MTA3Q9BTC8 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
MTA3Q9BTC8 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MTA3Q9BTC8 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
MTA3Q9BTC8 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
MTA3Q9BTC8 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MTA3Q9BTC8 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MTA3Q9BTC8 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
MTA3Q9BTC8 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
MTA3Q9BTC8 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
MTA3Q9BTC8 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
MTA3Q9BTC8 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
MTA3Q9BTC8 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
MTA3Q9BTC8 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MTA3Q9BTC8 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MTA3Q9BTC8 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MTA3Q9BTC8 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MTA3Q9BTC8 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MTA3Q9BTC8 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MTA3Q9BTC8 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MTA3Q9BTC8 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MTA3Q9BTC8 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MTA3Q9BTC8 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MTA3Q9BTC8 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MTA3Q9BTC8 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MTA3Q9BTC8 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MTA3Q9BTC8 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MTA3Q9BTC8 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MTA3Q9BTC8 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MTA3Q9BTC8 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.2 ms