Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSG0

PRADC1, Protease-associated domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRADC1Q9BSG0 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
PRADC1Q9BSG0 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRADC1Q9BSG0 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRADC1Q9BSG0 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PRADC1Q9BSG0 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRADC1Q9BSG0 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRADC1Q9BSG0 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRADC1Q9BSG0 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PRADC1Q9BSG0 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRADC1Q9BSG0 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRADC1Q9BSG0 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRADC1Q9BSG0 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRADC1Q9BSG0 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRADC1Q9BSG0 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRADC1Q9BSG0 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRADC1Q9BSG0 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRADC1Q9BSG0 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PRADC1Q9BSG0 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRADC1Q9BSG0 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRADC1Q9BSG0 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRADC1Q9BSG0 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRADC1Q9BSG0 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRADC1Q9BSG0 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRADC1Q9BSG0 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRADC1Q9BSG0 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRADC1Q9BSG0 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRADC1Q9BSG0 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRADC1Q9BSG0 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRADC1Q9BSG0 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRADC1Q9BSG0 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PRADC1Q9BSG0 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRADC1Q9BSG0 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRADC1Q9BSG0 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRADC1Q9BSG0 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRADC1Q9BSG0 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRADC1Q9BSG0 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRADC1Q9BSG0 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRADC1Q9BSG0 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRADC1Q9BSG0 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRADC1Q9BSG0 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRADC1Q9BSG0 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRADC1Q9BSG0 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRADC1Q9BSG0 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRADC1Q9BSG0 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRADC1Q9BSG0 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRADC1Q9BSG0 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRADC1Q9BSG0 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRADC1Q9BSG0 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRADC1Q9BSG0 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRADC1Q9BSG0 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRADC1Q9BSG0 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRADC1Q9BSG0 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRADC1Q9BSG0 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRADC1Q9BSG0 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PRADC1Q9BSG0 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PRADC1Q9BSG0 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PRADC1Q9BSG0 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PRADC1Q9BSG0 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PRADC1Q9BSG0 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PRADC1Q9BSG0 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PRADC1Q9BSG0 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PRADC1Q9BSG0 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PRADC1Q9BSG0 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PRADC1Q9BSG0 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PRADC1Q9BSG0 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PRADC1Q9BSG0 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PRADC1Q9BSG0 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PRADC1Q9BSG0 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PRADC1Q9BSG0 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PRADC1Q9BSG0 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PRADC1Q9BSG0 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PRADC1Q9BSG0 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PRADC1Q9BSG0 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PRADC1Q9BSG0 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PRADC1Q9BSG0 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PRADC1Q9BSG0 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PRADC1Q9BSG0 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PRADC1Q9BSG0 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PRADC1Q9BSG0 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PRADC1Q9BSG0 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PRADC1Q9BSG0 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PRADC1Q9BSG0 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PRADC1Q9BSG0 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PRADC1Q9BSG0 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PRADC1Q9BSG0 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PRADC1Q9BSG0 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PRADC1Q9BSG0 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PRADC1Q9BSG0 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PRADC1Q9BSG0 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PRADC1Q9BSG0 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PRADC1Q9BSG0 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PRADC1Q9BSG0 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PRADC1Q9BSG0 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PRADC1Q9BSG0 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PRADC1Q9BSG0 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PRADC1Q9BSG0 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PRADC1Q9BSG0 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PRADC1Q9BSG0 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PRADC1Q9BSG0 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PRADC1Q9BSG0 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms