Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRX5

GINS3, DNA replication complex GINS protein PSF3, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3Q9BRX5 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GINS3Q9BRX5 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms