Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR84

ZNF559, Zinc finger protein 559, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF559Q9BR84 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms