Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGIP1Q9BQI5 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGIP1Q9BQI5 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGIP1Q9BQI5 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGIP1Q9BQI5 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SGIP1Q9BQI5 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGIP1Q9BQI5 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGIP1Q9BQI5 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGIP1Q9BQI5 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SGIP1Q9BQI5 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGIP1Q9BQI5 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGIP1Q9BQI5 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGIP1Q9BQI5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGIP1Q9BQI5 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGIP1Q9BQI5 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGIP1Q9BQI5 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGIP1Q9BQI5 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGIP1Q9BQI5 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGIP1Q9BQI5 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGIP1Q9BQI5 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGIP1Q9BQI5 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGIP1Q9BQI5 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGIP1Q9BQI5 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGIP1Q9BQI5 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGIP1Q9BQI5 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SGIP1Q9BQI5 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGIP1Q9BQI5 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SGIP1Q9BQI5 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGIP1Q9BQI5 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGIP1Q9BQI5 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SGIP1Q9BQI5 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SGIP1Q9BQI5 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGIP1Q9BQI5 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGIP1Q9BQI5 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGIP1Q9BQI5 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGIP1Q9BQI5 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGIP1Q9BQI5 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SGIP1Q9BQI5 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGIP1Q9BQI5 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGIP1Q9BQI5 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGIP1Q9BQI5 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGIP1Q9BQI5 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGIP1Q9BQI5 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGIP1Q9BQI5 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGIP1Q9BQI5 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGIP1Q9BQI5 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGIP1Q9BQI5 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGIP1Q9BQI5 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SGIP1Q9BQI5 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SGIP1Q9BQI5 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGIP1Q9BQI5 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGIP1Q9BQI5 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGIP1Q9BQI5 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGIP1Q9BQI5 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGIP1Q9BQI5 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SGIP1Q9BQI5 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SGIP1Q9BQI5 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGIP1Q9BQI5 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGIP1Q9BQI5 Z99916.3-201ENST00000623422 1080 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SGIP1Q9BQI5 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGIP1Q9BQI5 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGIP1Q9BQI5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGIP1Q9BQI5 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGIP1Q9BQI5 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGIP1Q9BQI5 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGIP1Q9BQI5 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SGIP1Q9BQI5 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SGIP1Q9BQI5 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SGIP1Q9BQI5 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SGIP1Q9BQI5 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SGIP1Q9BQI5 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SGIP1Q9BQI5 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SGIP1Q9BQI5 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SGIP1Q9BQI5 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SGIP1Q9BQI5 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SGIP1Q9BQI5 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SGIP1Q9BQI5 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SGIP1Q9BQI5 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SGIP1Q9BQI5 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SGIP1Q9BQI5 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SGIP1Q9BQI5 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SGIP1Q9BQI5 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SGIP1Q9BQI5 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SGIP1Q9BQI5 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SGIP1Q9BQI5 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SGIP1Q9BQI5 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SGIP1Q9BQI5 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SGIP1Q9BQI5 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SGIP1Q9BQI5 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SGIP1Q9BQI5 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SGIP1Q9BQI5 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SGIP1Q9BQI5 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SGIP1Q9BQI5 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SGIP1Q9BQI5 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SGIP1Q9BQI5 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SGIP1Q9BQI5 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SGIP1Q9BQI5 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SGIP1Q9BQI5 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SGIP1Q9BQI5 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SGIP1Q9BQI5 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms