Protein–RNA interactions for Protein: Q99836

MYD88, Myeloid differentiation primary response protein MyD88, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYD88Q99836 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MYD88Q99836 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms