Protein–RNA interactions for Protein: Q96S66

CLCC1, Chloride channel CLIC-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCC1Q96S66 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLCC1Q96S66 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms