Protein–RNA interactions for Protein: Q96M27

PRRC1, Protein PRRC1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC1Q96M27 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms