Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN2

CCDC136, Coiled-coil domain-containing protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC136Q96JN2 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC136Q96JN2 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC136Q96JN2 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC136Q96JN2 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC136Q96JN2 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC136Q96JN2 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC136Q96JN2 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC136Q96JN2 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC136Q96JN2 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC136Q96JN2 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC136Q96JN2 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC136Q96JN2 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC136Q96JN2 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC136Q96JN2 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC136Q96JN2 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC136Q96JN2 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC136Q96JN2 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC136Q96JN2 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC136Q96JN2 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC136Q96JN2 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC136Q96JN2 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC136Q96JN2 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC136Q96JN2 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC136Q96JN2 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC136Q96JN2 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC136Q96JN2 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC136Q96JN2 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC136Q96JN2 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC136Q96JN2 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC136Q96JN2 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC136Q96JN2 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC136Q96JN2 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC136Q96JN2 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC136Q96JN2 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC136Q96JN2 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC136Q96JN2 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC136Q96JN2 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC136Q96JN2 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC136Q96JN2 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC136Q96JN2 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC136Q96JN2 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC136Q96JN2 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC136Q96JN2 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC136Q96JN2 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC136Q96JN2 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC136Q96JN2 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC136Q96JN2 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC136Q96JN2 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC136Q96JN2 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC136Q96JN2 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC136Q96JN2 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC136Q96JN2 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC136Q96JN2 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC136Q96JN2 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC136Q96JN2 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC136Q96JN2 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC136Q96JN2 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC136Q96JN2 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC136Q96JN2 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC136Q96JN2 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC136Q96JN2 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC136Q96JN2 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC136Q96JN2 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC136Q96JN2 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC136Q96JN2 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC136Q96JN2 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC136Q96JN2 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC136Q96JN2 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC136Q96JN2 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC136Q96JN2 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC136Q96JN2 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC136Q96JN2 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC136Q96JN2 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC136Q96JN2 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC136Q96JN2 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC136Q96JN2 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC136Q96JN2 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC136Q96JN2 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC136Q96JN2 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC136Q96JN2 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC136Q96JN2 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC136Q96JN2 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC136Q96JN2 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC136Q96JN2 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC136Q96JN2 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC136Q96JN2 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC136Q96JN2 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC136Q96JN2 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC136Q96JN2 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC136Q96JN2 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC136Q96JN2 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC136Q96JN2 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC136Q96JN2 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC136Q96JN2 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC136Q96JN2 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC136Q96JN2 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC136Q96JN2 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC136Q96JN2 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC136Q96JN2 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC136Q96JN2 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms