Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COG3Q96JB2 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COG3Q96JB2 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COG3Q96JB2 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COG3Q96JB2 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COG3Q96JB2 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COG3Q96JB2 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COG3Q96JB2 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COG3Q96JB2 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COG3Q96JB2 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COG3Q96JB2 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COG3Q96JB2 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
COG3Q96JB2 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COG3Q96JB2 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
COG3Q96JB2 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COG3Q96JB2 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COG3Q96JB2 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COG3Q96JB2 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COG3Q96JB2 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COG3Q96JB2 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
COG3Q96JB2 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COG3Q96JB2 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COG3Q96JB2 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COG3Q96JB2 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
COG3Q96JB2 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COG3Q96JB2 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COG3Q96JB2 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
COG3Q96JB2 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
COG3Q96JB2 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
COG3Q96JB2 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COG3Q96JB2 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COG3Q96JB2 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COG3Q96JB2 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COG3Q96JB2 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COG3Q96JB2 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COG3Q96JB2 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COG3Q96JB2 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COG3Q96JB2 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COG3Q96JB2 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COG3Q96JB2 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COG3Q96JB2 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
COG3Q96JB2 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
COG3Q96JB2 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COG3Q96JB2 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COG3Q96JB2 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
COG3Q96JB2 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COG3Q96JB2 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
COG3Q96JB2 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
COG3Q96JB2 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COG3Q96JB2 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COG3Q96JB2 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
COG3Q96JB2 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COG3Q96JB2 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COG3Q96JB2 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COG3Q96JB2 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COG3Q96JB2 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COG3Q96JB2 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COG3Q96JB2 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COG3Q96JB2 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COG3Q96JB2 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COG3Q96JB2 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COG3Q96JB2 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COG3Q96JB2 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
COG3Q96JB2 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COG3Q96JB2 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COG3Q96JB2 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COG3Q96JB2 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COG3Q96JB2 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
COG3Q96JB2 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COG3Q96JB2 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COG3Q96JB2 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COG3Q96JB2 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COG3Q96JB2 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COG3Q96JB2 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COG3Q96JB2 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COG3Q96JB2 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COG3Q96JB2 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COG3Q96JB2 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COG3Q96JB2 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COG3Q96JB2 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COG3Q96JB2 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COG3Q96JB2 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COG3Q96JB2 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COG3Q96JB2 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COG3Q96JB2 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COG3Q96JB2 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COG3Q96JB2 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COG3Q96JB2 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COG3Q96JB2 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
COG3Q96JB2 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COG3Q96JB2 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COG3Q96JB2 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COG3Q96JB2 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COG3Q96JB2 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COG3Q96JB2 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COG3Q96JB2 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COG3Q96JB2 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COG3Q96JB2 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COG3Q96JB2 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
COG3Q96JB2 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms