Protein–RNA interactions for Protein: Q96CF2

CHMP4C, Charged multivesicular body protein 4c, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4CQ96CF2 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHMP4CQ96CF2 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms