Protein–RNA interactions for Protein: Q96BD6

SPSB1, SPRY domain-containing SOCS box protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPSB1Q96BD6 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SPSB1Q96BD6 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms