Protein–RNA interactions for Protein: Q92878

RAD50, DNA repair protein RAD50, humanhuman

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD50Q92878 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAD50Q92878 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAD50Q92878 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAD50Q92878 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RAD50Q92878 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RAD50Q92878 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RAD50Q92878 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RAD50Q92878 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RAD50Q92878 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RAD50Q92878 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAD50Q92878 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms