Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXI9

GATAD2B, Transcriptional repressor p66-beta, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATAD2BQ8WXI9 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GATAD2BQ8WXI9 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms