Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDW7

FAT3, Protocadherin Fat 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,589 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAT3Q8TDW7 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC10.51□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC10.51□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC10.5□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
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