Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDC3

BRSK1, Serine/threonine-protein kinase BRSK1, humanhuman

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRSK1Q8TDC3 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BRSK1Q8TDC3 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms