Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU0

BEST4, Bestrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST4Q8NFU0 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
BEST4Q8NFU0 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms