Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC112Q8NEF3 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms