Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW8

TTC21A, Tetratricopeptide repeat protein 21A, humanhuman

Predictions only

Length 1,320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC21AQ8NDW8 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTC21AQ8NDW8 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTC21AQ8NDW8 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTC21AQ8NDW8 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTC21AQ8NDW8 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTC21AQ8NDW8 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTC21AQ8NDW8 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTC21AQ8NDW8 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTC21AQ8NDW8 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TTC21AQ8NDW8 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TTC21AQ8NDW8 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTC21AQ8NDW8 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTC21AQ8NDW8 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTC21AQ8NDW8 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTC21AQ8NDW8 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTC21AQ8NDW8 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTC21AQ8NDW8 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTC21AQ8NDW8 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTC21AQ8NDW8 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TTC21AQ8NDW8 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTC21AQ8NDW8 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTC21AQ8NDW8 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TTC21AQ8NDW8 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTC21AQ8NDW8 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TTC21AQ8NDW8 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TTC21AQ8NDW8 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TTC21AQ8NDW8 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TTC21AQ8NDW8 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TTC21AQ8NDW8 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TTC21AQ8NDW8 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TTC21AQ8NDW8 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TTC21AQ8NDW8 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TTC21AQ8NDW8 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TTC21AQ8NDW8 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TTC21AQ8NDW8 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TTC21AQ8NDW8 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TTC21AQ8NDW8 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TTC21AQ8NDW8 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TTC21AQ8NDW8 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TTC21AQ8NDW8 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TTC21AQ8NDW8 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TTC21AQ8NDW8 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
TTC21AQ8NDW8 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
TTC21AQ8NDW8 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TTC21AQ8NDW8 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TTC21AQ8NDW8 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTC21AQ8NDW8 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTC21AQ8NDW8 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTC21AQ8NDW8 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTC21AQ8NDW8 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTC21AQ8NDW8 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTC21AQ8NDW8 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TTC21AQ8NDW8 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTC21AQ8NDW8 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTC21AQ8NDW8 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTC21AQ8NDW8 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTC21AQ8NDW8 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTC21AQ8NDW8 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TTC21AQ8NDW8 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTC21AQ8NDW8 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TTC21AQ8NDW8 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTC21AQ8NDW8 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTC21AQ8NDW8 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTC21AQ8NDW8 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TTC21AQ8NDW8 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTC21AQ8NDW8 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTC21AQ8NDW8 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTC21AQ8NDW8 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTC21AQ8NDW8 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTC21AQ8NDW8 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTC21AQ8NDW8 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTC21AQ8NDW8 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTC21AQ8NDW8 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTC21AQ8NDW8 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTC21AQ8NDW8 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTC21AQ8NDW8 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTC21AQ8NDW8 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTC21AQ8NDW8 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTC21AQ8NDW8 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTC21AQ8NDW8 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTC21AQ8NDW8 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTC21AQ8NDW8 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTC21AQ8NDW8 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTC21AQ8NDW8 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTC21AQ8NDW8 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTC21AQ8NDW8 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTC21AQ8NDW8 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTC21AQ8NDW8 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTC21AQ8NDW8 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTC21AQ8NDW8 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TTC21AQ8NDW8 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TTC21AQ8NDW8 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTC21AQ8NDW8 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTC21AQ8NDW8 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTC21AQ8NDW8 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTC21AQ8NDW8 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTC21AQ8NDW8 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTC21AQ8NDW8 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTC21AQ8NDW8 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTC21AQ8NDW8 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
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