Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9L1

ZIC4, Zinc finger protein ZIC 4, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC4Q8N9L1 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms