Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms