Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y7

KRT28, Keratin, type I cytoskeletal 28, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT28Q7Z3Y7 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT28Q7Z3Y7 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT28Q7Z3Y7 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT28Q7Z3Y7 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT28Q7Z3Y7 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT28Q7Z3Y7 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT28Q7Z3Y7 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT28Q7Z3Y7 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT28Q7Z3Y7 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT28Q7Z3Y7 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT28Q7Z3Y7 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT28Q7Z3Y7 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT28Q7Z3Y7 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT28Q7Z3Y7 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT28Q7Z3Y7 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT28Q7Z3Y7 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT28Q7Z3Y7 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT28Q7Z3Y7 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT28Q7Z3Y7 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT28Q7Z3Y7 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT28Q7Z3Y7 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT28Q7Z3Y7 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT28Q7Z3Y7 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT28Q7Z3Y7 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT28Q7Z3Y7 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT28Q7Z3Y7 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT28Q7Z3Y7 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT28Q7Z3Y7 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT28Q7Z3Y7 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT28Q7Z3Y7 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT28Q7Z3Y7 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT28Q7Z3Y7 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT28Q7Z3Y7 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT28Q7Z3Y7 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT28Q7Z3Y7 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT28Q7Z3Y7 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT28Q7Z3Y7 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT28Q7Z3Y7 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT28Q7Z3Y7 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT28Q7Z3Y7 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT28Q7Z3Y7 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT28Q7Z3Y7 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT28Q7Z3Y7 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT28Q7Z3Y7 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT28Q7Z3Y7 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
KRT28Q7Z3Y7 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT28Q7Z3Y7 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT28Q7Z3Y7 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT28Q7Z3Y7 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT28Q7Z3Y7 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT28Q7Z3Y7 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT28Q7Z3Y7 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT28Q7Z3Y7 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT28Q7Z3Y7 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT28Q7Z3Y7 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT28Q7Z3Y7 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT28Q7Z3Y7 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT28Q7Z3Y7 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT28Q7Z3Y7 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT28Q7Z3Y7 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT28Q7Z3Y7 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT28Q7Z3Y7 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT28Q7Z3Y7 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT28Q7Z3Y7 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT28Q7Z3Y7 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT28Q7Z3Y7 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT28Q7Z3Y7 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT28Q7Z3Y7 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT28Q7Z3Y7 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT28Q7Z3Y7 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT28Q7Z3Y7 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT28Q7Z3Y7 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT28Q7Z3Y7 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT28Q7Z3Y7 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT28Q7Z3Y7 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT28Q7Z3Y7 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT28Q7Z3Y7 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT28Q7Z3Y7 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT28Q7Z3Y7 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT28Q7Z3Y7 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT28Q7Z3Y7 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT28Q7Z3Y7 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT28Q7Z3Y7 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT28Q7Z3Y7 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT28Q7Z3Y7 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT28Q7Z3Y7 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT28Q7Z3Y7 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT28Q7Z3Y7 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT28Q7Z3Y7 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT28Q7Z3Y7 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT28Q7Z3Y7 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT28Q7Z3Y7 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT28Q7Z3Y7 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT28Q7Z3Y7 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT28Q7Z3Y7 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT28Q7Z3Y7 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT28Q7Z3Y7 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT28Q7Z3Y7 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT28Q7Z3Y7 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT28Q7Z3Y7 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms