Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z398

ZNF550, Zinc finger protein 550, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF550Q7Z398 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF550Q7Z398 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF550Q7Z398 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF550Q7Z398 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF550Q7Z398 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF550Q7Z398 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF550Q7Z398 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF550Q7Z398 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF550Q7Z398 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF550Q7Z398 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF550Q7Z398 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF550Q7Z398 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF550Q7Z398 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF550Q7Z398 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF550Q7Z398 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF550Q7Z398 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF550Q7Z398 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF550Q7Z398 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF550Q7Z398 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF550Q7Z398 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF550Q7Z398 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF550Q7Z398 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF550Q7Z398 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF550Q7Z398 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF550Q7Z398 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF550Q7Z398 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF550Q7Z398 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF550Q7Z398 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF550Q7Z398 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF550Q7Z398 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF550Q7Z398 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF550Q7Z398 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF550Q7Z398 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF550Q7Z398 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF550Q7Z398 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF550Q7Z398 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF550Q7Z398 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF550Q7Z398 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF550Q7Z398 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF550Q7Z398 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF550Q7Z398 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF550Q7Z398 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF550Q7Z398 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF550Q7Z398 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF550Q7Z398 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF550Q7Z398 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF550Q7Z398 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF550Q7Z398 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF550Q7Z398 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF550Q7Z398 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF550Q7Z398 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF550Q7Z398 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF550Q7Z398 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF550Q7Z398 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF550Q7Z398 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF550Q7Z398 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF550Q7Z398 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF550Q7Z398 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF550Q7Z398 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF550Q7Z398 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF550Q7Z398 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF550Q7Z398 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF550Q7Z398 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF550Q7Z398 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF550Q7Z398 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF550Q7Z398 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF550Q7Z398 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF550Q7Z398 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF550Q7Z398 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF550Q7Z398 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF550Q7Z398 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF550Q7Z398 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF550Q7Z398 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF550Q7Z398 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF550Q7Z398 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF550Q7Z398 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF550Q7Z398 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF550Q7Z398 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF550Q7Z398 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF550Q7Z398 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF550Q7Z398 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF550Q7Z398 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF550Q7Z398 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF550Q7Z398 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF550Q7Z398 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ZNF550Q7Z398 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ZNF550Q7Z398 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ZNF550Q7Z398 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ZNF550Q7Z398 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ZNF550Q7Z398 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ZNF550Q7Z398 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ZNF550Q7Z398 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79 ms