Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT9

SLC29A4, Equilibrative nucleoside transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC29A4Q7RTT9 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms