Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC9

SMIM5, Small integral membrane protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM5Q71RC9 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMIM5Q71RC9 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMIM5Q71RC9 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMIM5Q71RC9 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMIM5Q71RC9 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMIM5Q71RC9 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMIM5Q71RC9 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMIM5Q71RC9 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMIM5Q71RC9 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMIM5Q71RC9 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMIM5Q71RC9 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMIM5Q71RC9 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMIM5Q71RC9 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMIM5Q71RC9 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMIM5Q71RC9 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMIM5Q71RC9 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMIM5Q71RC9 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMIM5Q71RC9 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMIM5Q71RC9 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMIM5Q71RC9 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMIM5Q71RC9 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMIM5Q71RC9 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMIM5Q71RC9 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMIM5Q71RC9 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMIM5Q71RC9 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMIM5Q71RC9 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMIM5Q71RC9 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMIM5Q71RC9 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMIM5Q71RC9 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMIM5Q71RC9 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMIM5Q71RC9 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMIM5Q71RC9 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMIM5Q71RC9 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMIM5Q71RC9 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMIM5Q71RC9 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMIM5Q71RC9 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMIM5Q71RC9 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMIM5Q71RC9 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMIM5Q71RC9 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMIM5Q71RC9 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMIM5Q71RC9 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMIM5Q71RC9 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMIM5Q71RC9 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMIM5Q71RC9 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMIM5Q71RC9 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SMIM5Q71RC9 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMIM5Q71RC9 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMIM5Q71RC9 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMIM5Q71RC9 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SMIM5Q71RC9 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SMIM5Q71RC9 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SMIM5Q71RC9 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SMIM5Q71RC9 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMIM5Q71RC9 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMIM5Q71RC9 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMIM5Q71RC9 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMIM5Q71RC9 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMIM5Q71RC9 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMIM5Q71RC9 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMIM5Q71RC9 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMIM5Q71RC9 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMIM5Q71RC9 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMIM5Q71RC9 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMIM5Q71RC9 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMIM5Q71RC9 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMIM5Q71RC9 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMIM5Q71RC9 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMIM5Q71RC9 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMIM5Q71RC9 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMIM5Q71RC9 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMIM5Q71RC9 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMIM5Q71RC9 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMIM5Q71RC9 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMIM5Q71RC9 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SMIM5Q71RC9 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMIM5Q71RC9 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMIM5Q71RC9 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMIM5Q71RC9 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMIM5Q71RC9 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMIM5Q71RC9 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMIM5Q71RC9 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMIM5Q71RC9 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMIM5Q71RC9 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMIM5Q71RC9 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMIM5Q71RC9 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SMIM5Q71RC9 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMIM5Q71RC9 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMIM5Q71RC9 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SMIM5Q71RC9 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMIM5Q71RC9 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMIM5Q71RC9 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SMIM5Q71RC9 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SMIM5Q71RC9 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMIM5Q71RC9 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMIM5Q71RC9 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMIM5Q71RC9 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMIM5Q71RC9 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMIM5Q71RC9 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMIM5Q71RC9 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMIM5Q71RC9 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms