Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW49

PAXIP1, PAX-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,069 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXIP1Q6ZW49 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PAXIP1Q6ZW49 AC132872.1-201ENST00000566986 1195 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PAXIP1Q6ZW49 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PAXIP1Q6ZW49 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PAXIP1Q6ZW49 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PAXIP1Q6ZW49 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PAXIP1Q6ZW49 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PAXIP1Q6ZW49 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PAXIP1Q6ZW49 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PAXIP1Q6ZW49 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PAXIP1Q6ZW49 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PAXIP1Q6ZW49 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PAXIP1Q6ZW49 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PAXIP1Q6ZW49 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PAXIP1Q6ZW49 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PAXIP1Q6ZW49 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms