Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQX7

LIAT1, Protein LIAT1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIAT1Q6ZQX7 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 SULT1A1-211ENST00000569554 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LIAT1Q6ZQX7 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
LIAT1Q6ZQX7 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LIAT1Q6ZQX7 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
LIAT1Q6ZQX7 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
LIAT1Q6ZQX7 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LIAT1Q6ZQX7 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
LIAT1Q6ZQX7 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LIAT1Q6ZQX7 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LIAT1Q6ZQX7 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LIAT1Q6ZQX7 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LIAT1Q6ZQX7 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LIAT1Q6ZQX7 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LIAT1Q6ZQX7 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LIAT1Q6ZQX7 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LIAT1Q6ZQX7 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LIAT1Q6ZQX7 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LIAT1Q6ZQX7 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LIAT1Q6ZQX7 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LIAT1Q6ZQX7 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LIAT1Q6ZQX7 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LIAT1Q6ZQX7 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LIAT1Q6ZQX7 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LIAT1Q6ZQX7 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LIAT1Q6ZQX7 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LIAT1Q6ZQX7 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LIAT1Q6ZQX7 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LIAT1Q6ZQX7 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LIAT1Q6ZQX7 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LIAT1Q6ZQX7 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LIAT1Q6ZQX7 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LIAT1Q6ZQX7 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LIAT1Q6ZQX7 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LIAT1Q6ZQX7 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LIAT1Q6ZQX7 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LIAT1Q6ZQX7 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LIAT1Q6ZQX7 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms