Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY6

WDR88, WD repeat-containing protein 88, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR88Q6ZMY6 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
WDR88Q6ZMY6 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
WDR88Q6ZMY6 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
WDR88Q6ZMY6 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
WDR88Q6ZMY6 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
WDR88Q6ZMY6 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms