Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms