Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX01

LMBR1L, Protein LMBR1L, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBR1LQ6UX01 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
LMBR1LQ6UX01 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms