Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZBED9Q6R2W3 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZBED9Q6R2W3 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZBED9Q6R2W3 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZBED9Q6R2W3 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZBED9Q6R2W3 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZBED9Q6R2W3 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZBED9Q6R2W3 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZBED9Q6R2W3 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZBED9Q6R2W3 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZBED9Q6R2W3 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZBED9Q6R2W3 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZBED9Q6R2W3 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ZBED9Q6R2W3 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ZBED9Q6R2W3 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZBED9Q6R2W3 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZBED9Q6R2W3 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZBED9Q6R2W3 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZBED9Q6R2W3 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZBED9Q6R2W3 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZBED9Q6R2W3 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ZBED9Q6R2W3 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZBED9Q6R2W3 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZBED9Q6R2W3 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZBED9Q6R2W3 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZBED9Q6R2W3 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZBED9Q6R2W3 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZBED9Q6R2W3 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZBED9Q6R2W3 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZBED9Q6R2W3 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ZBED9Q6R2W3 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZBED9Q6R2W3 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZBED9Q6R2W3 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZBED9Q6R2W3 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZBED9Q6R2W3 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZBED9Q6R2W3 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZBED9Q6R2W3 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZBED9Q6R2W3 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZBED9Q6R2W3 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZBED9Q6R2W3 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZBED9Q6R2W3 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZBED9Q6R2W3 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZBED9Q6R2W3 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZBED9Q6R2W3 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZBED9Q6R2W3 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZBED9Q6R2W3 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZBED9Q6R2W3 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZBED9Q6R2W3 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZBED9Q6R2W3 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZBED9Q6R2W3 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZBED9Q6R2W3 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZBED9Q6R2W3 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZBED9Q6R2W3 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZBED9Q6R2W3 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZBED9Q6R2W3 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZBED9Q6R2W3 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZBED9Q6R2W3 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZBED9Q6R2W3 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZBED9Q6R2W3 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZBED9Q6R2W3 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
ZBED9Q6R2W3 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ZBED9Q6R2W3 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZBED9Q6R2W3 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZBED9Q6R2W3 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZBED9Q6R2W3 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZBED9Q6R2W3 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ZBED9Q6R2W3 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZBED9Q6R2W3 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ZBED9Q6R2W3 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZBED9Q6R2W3 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZBED9Q6R2W3 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZBED9Q6R2W3 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ZBED9Q6R2W3 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZBED9Q6R2W3 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZBED9Q6R2W3 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZBED9Q6R2W3 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZBED9Q6R2W3 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZBED9Q6R2W3 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZBED9Q6R2W3 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZBED9Q6R2W3 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZBED9Q6R2W3 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZBED9Q6R2W3 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZBED9Q6R2W3 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZBED9Q6R2W3 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZBED9Q6R2W3 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZBED9Q6R2W3 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ZBED9Q6R2W3 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZBED9Q6R2W3 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZBED9Q6R2W3 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZBED9Q6R2W3 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZBED9Q6R2W3 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZBED9Q6R2W3 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZBED9Q6R2W3 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ZBED9Q6R2W3 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZBED9Q6R2W3 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZBED9Q6R2W3 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZBED9Q6R2W3 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ZBED9Q6R2W3 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZBED9Q6R2W3 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZBED9Q6R2W3 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms