Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDB4

ZNF880, Zinc finger protein 880, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF880Q6PDB4 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF880Q6PDB4 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF880Q6PDB4 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF880Q6PDB4 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF880Q6PDB4 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF880Q6PDB4 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF880Q6PDB4 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF880Q6PDB4 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF880Q6PDB4 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF880Q6PDB4 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF880Q6PDB4 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF880Q6PDB4 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF880Q6PDB4 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF880Q6PDB4 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF880Q6PDB4 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF880Q6PDB4 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF880Q6PDB4 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF880Q6PDB4 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF880Q6PDB4 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF880Q6PDB4 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZNF880Q6PDB4 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
ZNF880Q6PDB4 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZNF880Q6PDB4 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZNF880Q6PDB4 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZNF880Q6PDB4 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZNF880Q6PDB4 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZNF880Q6PDB4 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF880Q6PDB4 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF880Q6PDB4 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF880Q6PDB4 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF880Q6PDB4 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF880Q6PDB4 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF880Q6PDB4 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ZNF880Q6PDB4 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF880Q6PDB4 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF880Q6PDB4 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF880Q6PDB4 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF880Q6PDB4 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF880Q6PDB4 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF880Q6PDB4 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF880Q6PDB4 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF880Q6PDB4 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ZNF880Q6PDB4 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF880Q6PDB4 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF880Q6PDB4 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF880Q6PDB4 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF880Q6PDB4 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF880Q6PDB4 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF880Q6PDB4 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF880Q6PDB4 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF880Q6PDB4 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF880Q6PDB4 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF880Q6PDB4 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF880Q6PDB4 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF880Q6PDB4 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF880Q6PDB4 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF880Q6PDB4 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ZNF880Q6PDB4 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF880Q6PDB4 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF880Q6PDB4 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF880Q6PDB4 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF880Q6PDB4 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF880Q6PDB4 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF880Q6PDB4 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF880Q6PDB4 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF880Q6PDB4 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF880Q6PDB4 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF880Q6PDB4 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF880Q6PDB4 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF880Q6PDB4 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF880Q6PDB4 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF880Q6PDB4 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF880Q6PDB4 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF880Q6PDB4 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF880Q6PDB4 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF880Q6PDB4 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF880Q6PDB4 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF880Q6PDB4 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF880Q6PDB4 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF880Q6PDB4 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF880Q6PDB4 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF880Q6PDB4 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF880Q6PDB4 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF880Q6PDB4 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF880Q6PDB4 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF880Q6PDB4 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF880Q6PDB4 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF880Q6PDB4 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF880Q6PDB4 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF880Q6PDB4 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF880Q6PDB4 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF880Q6PDB4 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF880Q6PDB4 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF880Q6PDB4 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF880Q6PDB4 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF880Q6PDB4 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF880Q6PDB4 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF880Q6PDB4 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF880Q6PDB4 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF880Q6PDB4 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms