Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5Q4

LMOD2, Leiomodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD2Q6P5Q4 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LMOD2Q6P5Q4 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LMOD2Q6P5Q4 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LMOD2Q6P5Q4 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
LMOD2Q6P5Q4 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
LMOD2Q6P5Q4 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMOD2Q6P5Q4 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMOD2Q6P5Q4 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMOD2Q6P5Q4 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMOD2Q6P5Q4 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMOD2Q6P5Q4 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMOD2Q6P5Q4 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMOD2Q6P5Q4 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
LMOD2Q6P5Q4 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
LMOD2Q6P5Q4 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
LMOD2Q6P5Q4 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMOD2Q6P5Q4 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
LMOD2Q6P5Q4 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMOD2Q6P5Q4 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMOD2Q6P5Q4 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMOD2Q6P5Q4 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMOD2Q6P5Q4 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMOD2Q6P5Q4 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
LMOD2Q6P5Q4 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMOD2Q6P5Q4 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMOD2Q6P5Q4 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMOD2Q6P5Q4 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMOD2Q6P5Q4 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMOD2Q6P5Q4 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMOD2Q6P5Q4 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMOD2Q6P5Q4 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMOD2Q6P5Q4 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
LMOD2Q6P5Q4 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMOD2Q6P5Q4 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMOD2Q6P5Q4 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMOD2Q6P5Q4 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMOD2Q6P5Q4 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
LMOD2Q6P5Q4 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMOD2Q6P5Q4 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
LMOD2Q6P5Q4 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMOD2Q6P5Q4 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMOD2Q6P5Q4 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMOD2Q6P5Q4 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMOD2Q6P5Q4 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMOD2Q6P5Q4 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMOD2Q6P5Q4 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMOD2Q6P5Q4 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMOD2Q6P5Q4 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMOD2Q6P5Q4 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMOD2Q6P5Q4 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMOD2Q6P5Q4 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMOD2Q6P5Q4 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMOD2Q6P5Q4 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMOD2Q6P5Q4 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMOD2Q6P5Q4 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMOD2Q6P5Q4 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMOD2Q6P5Q4 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMOD2Q6P5Q4 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMOD2Q6P5Q4 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMOD2Q6P5Q4 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMOD2Q6P5Q4 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMOD2Q6P5Q4 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMOD2Q6P5Q4 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMOD2Q6P5Q4 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMOD2Q6P5Q4 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
LMOD2Q6P5Q4 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMOD2Q6P5Q4 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMOD2Q6P5Q4 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMOD2Q6P5Q4 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMOD2Q6P5Q4 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMOD2Q6P5Q4 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMOD2Q6P5Q4 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMOD2Q6P5Q4 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMOD2Q6P5Q4 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMOD2Q6P5Q4 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMOD2Q6P5Q4 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMOD2Q6P5Q4 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMOD2Q6P5Q4 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMOD2Q6P5Q4 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMOD2Q6P5Q4 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMOD2Q6P5Q4 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMOD2Q6P5Q4 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMOD2Q6P5Q4 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMOD2Q6P5Q4 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMOD2Q6P5Q4 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMOD2Q6P5Q4 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMOD2Q6P5Q4 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMOD2Q6P5Q4 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMOD2Q6P5Q4 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMOD2Q6P5Q4 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMOD2Q6P5Q4 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMOD2Q6P5Q4 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMOD2Q6P5Q4 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMOD2Q6P5Q4 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMOD2Q6P5Q4 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMOD2Q6P5Q4 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMOD2Q6P5Q4 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMOD2Q6P5Q4 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMOD2Q6P5Q4 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMOD2Q6P5Q4 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms