Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUQ1

RINT1, RAD50-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 792 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RINT1Q6NUQ1 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RINT1Q6NUQ1 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RINT1Q6NUQ1 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RINT1Q6NUQ1 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RINT1Q6NUQ1 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RINT1Q6NUQ1 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RINT1Q6NUQ1 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RINT1Q6NUQ1 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RINT1Q6NUQ1 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RINT1Q6NUQ1 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RINT1Q6NUQ1 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RINT1Q6NUQ1 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RINT1Q6NUQ1 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
RINT1Q6NUQ1 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RINT1Q6NUQ1 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RINT1Q6NUQ1 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RINT1Q6NUQ1 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RINT1Q6NUQ1 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
RINT1Q6NUQ1 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
RINT1Q6NUQ1 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
RINT1Q6NUQ1 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RINT1Q6NUQ1 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RINT1Q6NUQ1 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RINT1Q6NUQ1 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RINT1Q6NUQ1 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RINT1Q6NUQ1 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RINT1Q6NUQ1 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RINT1Q6NUQ1 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RINT1Q6NUQ1 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RINT1Q6NUQ1 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RINT1Q6NUQ1 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RINT1Q6NUQ1 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RINT1Q6NUQ1 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RINT1Q6NUQ1 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RINT1Q6NUQ1 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RINT1Q6NUQ1 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RINT1Q6NUQ1 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RINT1Q6NUQ1 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RINT1Q6NUQ1 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
RINT1Q6NUQ1 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RINT1Q6NUQ1 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RINT1Q6NUQ1 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RINT1Q6NUQ1 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RINT1Q6NUQ1 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RINT1Q6NUQ1 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RINT1Q6NUQ1 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RINT1Q6NUQ1 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RINT1Q6NUQ1 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RINT1Q6NUQ1 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RINT1Q6NUQ1 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RINT1Q6NUQ1 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RINT1Q6NUQ1 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RINT1Q6NUQ1 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
RINT1Q6NUQ1 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RINT1Q6NUQ1 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RINT1Q6NUQ1 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RINT1Q6NUQ1 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RINT1Q6NUQ1 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RINT1Q6NUQ1 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RINT1Q6NUQ1 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RINT1Q6NUQ1 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RINT1Q6NUQ1 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RINT1Q6NUQ1 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RINT1Q6NUQ1 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RINT1Q6NUQ1 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RINT1Q6NUQ1 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RINT1Q6NUQ1 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RINT1Q6NUQ1 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RINT1Q6NUQ1 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RINT1Q6NUQ1 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RINT1Q6NUQ1 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RINT1Q6NUQ1 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RINT1Q6NUQ1 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RINT1Q6NUQ1 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RINT1Q6NUQ1 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
RINT1Q6NUQ1 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RINT1Q6NUQ1 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RINT1Q6NUQ1 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RINT1Q6NUQ1 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RINT1Q6NUQ1 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
RINT1Q6NUQ1 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RINT1Q6NUQ1 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
RINT1Q6NUQ1 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RINT1Q6NUQ1 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RINT1Q6NUQ1 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RINT1Q6NUQ1 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RINT1Q6NUQ1 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
RINT1Q6NUQ1 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RINT1Q6NUQ1 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RINT1Q6NUQ1 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RINT1Q6NUQ1 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RINT1Q6NUQ1 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RINT1Q6NUQ1 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RINT1Q6NUQ1 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RINT1Q6NUQ1 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RINT1Q6NUQ1 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RINT1Q6NUQ1 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RINT1Q6NUQ1 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RINT1Q6NUQ1 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RINT1Q6NUQ1 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms