Protein–RNA interactions for Protein: Q68E01

INTS3, Integrator complex subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INTS3Q68E01 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms