Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWQ0

RSBN1, Round spermatid basic protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSBN1Q5VWQ0 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RSBN1Q5VWQ0 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RSBN1Q5VWQ0 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RSBN1Q5VWQ0 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RSBN1Q5VWQ0 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RSBN1Q5VWQ0 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RSBN1Q5VWQ0 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RSBN1Q5VWQ0 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RSBN1Q5VWQ0 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RSBN1Q5VWQ0 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RSBN1Q5VWQ0 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RSBN1Q5VWQ0 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RSBN1Q5VWQ0 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RSBN1Q5VWQ0 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RSBN1Q5VWQ0 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RSBN1Q5VWQ0 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RSBN1Q5VWQ0 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RSBN1Q5VWQ0 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RSBN1Q5VWQ0 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RSBN1Q5VWQ0 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RSBN1Q5VWQ0 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RSBN1Q5VWQ0 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RSBN1Q5VWQ0 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RSBN1Q5VWQ0 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RSBN1Q5VWQ0 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RSBN1Q5VWQ0 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RSBN1Q5VWQ0 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RSBN1Q5VWQ0 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RSBN1Q5VWQ0 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RSBN1Q5VWQ0 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RSBN1Q5VWQ0 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RSBN1Q5VWQ0 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RSBN1Q5VWQ0 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RSBN1Q5VWQ0 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RSBN1Q5VWQ0 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RSBN1Q5VWQ0 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RSBN1Q5VWQ0 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RSBN1Q5VWQ0 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RSBN1Q5VWQ0 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RSBN1Q5VWQ0 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RSBN1Q5VWQ0 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RSBN1Q5VWQ0 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RSBN1Q5VWQ0 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RSBN1Q5VWQ0 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RSBN1Q5VWQ0 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RSBN1Q5VWQ0 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RSBN1Q5VWQ0 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
RSBN1Q5VWQ0 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RSBN1Q5VWQ0 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RSBN1Q5VWQ0 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RSBN1Q5VWQ0 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RSBN1Q5VWQ0 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RSBN1Q5VWQ0 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RSBN1Q5VWQ0 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RSBN1Q5VWQ0 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RSBN1Q5VWQ0 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RSBN1Q5VWQ0 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RSBN1Q5VWQ0 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RSBN1Q5VWQ0 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RSBN1Q5VWQ0 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RSBN1Q5VWQ0 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RSBN1Q5VWQ0 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RSBN1Q5VWQ0 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RSBN1Q5VWQ0 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RSBN1Q5VWQ0 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RSBN1Q5VWQ0 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RSBN1Q5VWQ0 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RSBN1Q5VWQ0 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RSBN1Q5VWQ0 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RSBN1Q5VWQ0 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RSBN1Q5VWQ0 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RSBN1Q5VWQ0 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RSBN1Q5VWQ0 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RSBN1Q5VWQ0 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RSBN1Q5VWQ0 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RSBN1Q5VWQ0 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RSBN1Q5VWQ0 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RSBN1Q5VWQ0 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RSBN1Q5VWQ0 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RSBN1Q5VWQ0 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RSBN1Q5VWQ0 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RSBN1Q5VWQ0 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RSBN1Q5VWQ0 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RSBN1Q5VWQ0 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RSBN1Q5VWQ0 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RSBN1Q5VWQ0 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RSBN1Q5VWQ0 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RSBN1Q5VWQ0 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RSBN1Q5VWQ0 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RSBN1Q5VWQ0 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RSBN1Q5VWQ0 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RSBN1Q5VWQ0 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RSBN1Q5VWQ0 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RSBN1Q5VWQ0 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RSBN1Q5VWQ0 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RSBN1Q5VWQ0 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RSBN1Q5VWQ0 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RSBN1Q5VWQ0 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RSBN1Q5VWQ0 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RSBN1Q5VWQ0 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms