Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWP3

MLIP, Muscular LMNA-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLIPQ5VWP3 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MLIPQ5VWP3 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MLIPQ5VWP3 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
MLIPQ5VWP3 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
MLIPQ5VWP3 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MLIPQ5VWP3 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MLIPQ5VWP3 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MLIPQ5VWP3 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MLIPQ5VWP3 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MLIPQ5VWP3 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MLIPQ5VWP3 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MLIPQ5VWP3 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MLIPQ5VWP3 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MLIPQ5VWP3 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MLIPQ5VWP3 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MLIPQ5VWP3 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MLIPQ5VWP3 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MLIPQ5VWP3 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MLIPQ5VWP3 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MLIPQ5VWP3 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MLIPQ5VWP3 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MLIPQ5VWP3 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MLIPQ5VWP3 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MLIPQ5VWP3 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MLIPQ5VWP3 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MLIPQ5VWP3 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MLIPQ5VWP3 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MLIPQ5VWP3 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MLIPQ5VWP3 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MLIPQ5VWP3 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MLIPQ5VWP3 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MLIPQ5VWP3 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MLIPQ5VWP3 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MLIPQ5VWP3 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MLIPQ5VWP3 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MLIPQ5VWP3 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MLIPQ5VWP3 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MLIPQ5VWP3 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MLIPQ5VWP3 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MLIPQ5VWP3 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MLIPQ5VWP3 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MLIPQ5VWP3 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MLIPQ5VWP3 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MLIPQ5VWP3 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MLIPQ5VWP3 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MLIPQ5VWP3 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MLIPQ5VWP3 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MLIPQ5VWP3 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MLIPQ5VWP3 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MLIPQ5VWP3 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MLIPQ5VWP3 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MLIPQ5VWP3 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MLIPQ5VWP3 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MLIPQ5VWP3 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MLIPQ5VWP3 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MLIPQ5VWP3 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MLIPQ5VWP3 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MLIPQ5VWP3 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MLIPQ5VWP3 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MLIPQ5VWP3 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MLIPQ5VWP3 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MLIPQ5VWP3 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MLIPQ5VWP3 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MLIPQ5VWP3 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
MLIPQ5VWP3 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MLIPQ5VWP3 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
MLIPQ5VWP3 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MLIPQ5VWP3 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MLIPQ5VWP3 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
MLIPQ5VWP3 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MLIPQ5VWP3 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MLIPQ5VWP3 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MLIPQ5VWP3 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MLIPQ5VWP3 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MLIPQ5VWP3 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MLIPQ5VWP3 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MLIPQ5VWP3 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MLIPQ5VWP3 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MLIPQ5VWP3 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MLIPQ5VWP3 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MLIPQ5VWP3 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MLIPQ5VWP3 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MLIPQ5VWP3 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MLIPQ5VWP3 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MLIPQ5VWP3 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MLIPQ5VWP3 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MLIPQ5VWP3 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
MLIPQ5VWP3 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MLIPQ5VWP3 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MLIPQ5VWP3 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MLIPQ5VWP3 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MLIPQ5VWP3 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MLIPQ5VWP3 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MLIPQ5VWP3 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MLIPQ5VWP3 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MLIPQ5VWP3 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MLIPQ5VWP3 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MLIPQ5VWP3 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MLIPQ5VWP3 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MLIPQ5VWP3 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms