Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGJ6

HDGFL1, Hepatoma-derived growth factor-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL1Q5TGJ6 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDGFL1Q5TGJ6 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDGFL1Q5TGJ6 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDGFL1Q5TGJ6 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDGFL1Q5TGJ6 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDGFL1Q5TGJ6 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDGFL1Q5TGJ6 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDGFL1Q5TGJ6 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDGFL1Q5TGJ6 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDGFL1Q5TGJ6 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDGFL1Q5TGJ6 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDGFL1Q5TGJ6 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDGFL1Q5TGJ6 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDGFL1Q5TGJ6 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDGFL1Q5TGJ6 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDGFL1Q5TGJ6 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
HDGFL1Q5TGJ6 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDGFL1Q5TGJ6 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDGFL1Q5TGJ6 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDGFL1Q5TGJ6 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDGFL1Q5TGJ6 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDGFL1Q5TGJ6 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDGFL1Q5TGJ6 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
HDGFL1Q5TGJ6 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDGFL1Q5TGJ6 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDGFL1Q5TGJ6 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
HDGFL1Q5TGJ6 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
HDGFL1Q5TGJ6 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDGFL1Q5TGJ6 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDGFL1Q5TGJ6 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDGFL1Q5TGJ6 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDGFL1Q5TGJ6 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDGFL1Q5TGJ6 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDGFL1Q5TGJ6 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDGFL1Q5TGJ6 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDGFL1Q5TGJ6 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDGFL1Q5TGJ6 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HDGFL1Q5TGJ6 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HDGFL1Q5TGJ6 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HDGFL1Q5TGJ6 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HDGFL1Q5TGJ6 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDGFL1Q5TGJ6 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDGFL1Q5TGJ6 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDGFL1Q5TGJ6 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDGFL1Q5TGJ6 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDGFL1Q5TGJ6 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
HDGFL1Q5TGJ6 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDGFL1Q5TGJ6 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDGFL1Q5TGJ6 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDGFL1Q5TGJ6 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDGFL1Q5TGJ6 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDGFL1Q5TGJ6 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDGFL1Q5TGJ6 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDGFL1Q5TGJ6 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDGFL1Q5TGJ6 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDGFL1Q5TGJ6 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDGFL1Q5TGJ6 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDGFL1Q5TGJ6 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDGFL1Q5TGJ6 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDGFL1Q5TGJ6 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDGFL1Q5TGJ6 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDGFL1Q5TGJ6 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
HDGFL1Q5TGJ6 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDGFL1Q5TGJ6 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDGFL1Q5TGJ6 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDGFL1Q5TGJ6 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDGFL1Q5TGJ6 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDGFL1Q5TGJ6 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDGFL1Q5TGJ6 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDGFL1Q5TGJ6 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDGFL1Q5TGJ6 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDGFL1Q5TGJ6 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDGFL1Q5TGJ6 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDGFL1Q5TGJ6 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDGFL1Q5TGJ6 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
HDGFL1Q5TGJ6 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDGFL1Q5TGJ6 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDGFL1Q5TGJ6 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDGFL1Q5TGJ6 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
HDGFL1Q5TGJ6 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
HDGFL1Q5TGJ6 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDGFL1Q5TGJ6 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDGFL1Q5TGJ6 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDGFL1Q5TGJ6 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDGFL1Q5TGJ6 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDGFL1Q5TGJ6 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDGFL1Q5TGJ6 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDGFL1Q5TGJ6 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDGFL1Q5TGJ6 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDGFL1Q5TGJ6 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDGFL1Q5TGJ6 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDGFL1Q5TGJ6 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDGFL1Q5TGJ6 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDGFL1Q5TGJ6 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDGFL1Q5TGJ6 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDGFL1Q5TGJ6 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDGFL1Q5TGJ6 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HDGFL1Q5TGJ6 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDGFL1Q5TGJ6 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDGFL1Q5TGJ6 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms