Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2R2

PDSS1, Decaprenyl-diphosphate synthase subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDSS1Q5T2R2 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDSS1Q5T2R2 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDSS1Q5T2R2 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDSS1Q5T2R2 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDSS1Q5T2R2 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDSS1Q5T2R2 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDSS1Q5T2R2 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDSS1Q5T2R2 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDSS1Q5T2R2 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDSS1Q5T2R2 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDSS1Q5T2R2 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDSS1Q5T2R2 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDSS1Q5T2R2 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDSS1Q5T2R2 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDSS1Q5T2R2 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDSS1Q5T2R2 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDSS1Q5T2R2 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDSS1Q5T2R2 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDSS1Q5T2R2 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDSS1Q5T2R2 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDSS1Q5T2R2 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDSS1Q5T2R2 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDSS1Q5T2R2 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDSS1Q5T2R2 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDSS1Q5T2R2 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PDSS1Q5T2R2 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDSS1Q5T2R2 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDSS1Q5T2R2 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDSS1Q5T2R2 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDSS1Q5T2R2 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PDSS1Q5T2R2 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDSS1Q5T2R2 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDSS1Q5T2R2 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDSS1Q5T2R2 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDSS1Q5T2R2 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDSS1Q5T2R2 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDSS1Q5T2R2 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDSS1Q5T2R2 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDSS1Q5T2R2 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDSS1Q5T2R2 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDSS1Q5T2R2 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDSS1Q5T2R2 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDSS1Q5T2R2 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDSS1Q5T2R2 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDSS1Q5T2R2 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDSS1Q5T2R2 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDSS1Q5T2R2 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDSS1Q5T2R2 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDSS1Q5T2R2 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDSS1Q5T2R2 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDSS1Q5T2R2 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDSS1Q5T2R2 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDSS1Q5T2R2 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDSS1Q5T2R2 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDSS1Q5T2R2 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDSS1Q5T2R2 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PDSS1Q5T2R2 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDSS1Q5T2R2 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDSS1Q5T2R2 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PDSS1Q5T2R2 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDSS1Q5T2R2 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDSS1Q5T2R2 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDSS1Q5T2R2 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDSS1Q5T2R2 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDSS1Q5T2R2 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDSS1Q5T2R2 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDSS1Q5T2R2 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDSS1Q5T2R2 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDSS1Q5T2R2 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDSS1Q5T2R2 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDSS1Q5T2R2 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDSS1Q5T2R2 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDSS1Q5T2R2 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDSS1Q5T2R2 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDSS1Q5T2R2 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDSS1Q5T2R2 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDSS1Q5T2R2 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDSS1Q5T2R2 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDSS1Q5T2R2 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDSS1Q5T2R2 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDSS1Q5T2R2 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDSS1Q5T2R2 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDSS1Q5T2R2 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDSS1Q5T2R2 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDSS1Q5T2R2 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDSS1Q5T2R2 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDSS1Q5T2R2 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDSS1Q5T2R2 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDSS1Q5T2R2 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDSS1Q5T2R2 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PDSS1Q5T2R2 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDSS1Q5T2R2 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDSS1Q5T2R2 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDSS1Q5T2R2 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PDSS1Q5T2R2 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PDSS1Q5T2R2 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDSS1Q5T2R2 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDSS1Q5T2R2 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDSS1Q5T2R2 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDSS1Q5T2R2 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms