Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU26

COLEC12, Collectin-12, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLEC12Q5KU26 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
COLEC12Q5KU26 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms