Protein–RNA interactions for Protein: Q5K651

SAMD9, Sterile alpha motif domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD9Q5K651 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SAMD9Q5K651 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SAMD9Q5K651 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
SAMD9Q5K651 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
SAMD9Q5K651 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SAMD9Q5K651 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SAMD9Q5K651 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SAMD9Q5K651 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SAMD9Q5K651 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SAMD9Q5K651 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SAMD9Q5K651 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SAMD9Q5K651 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SAMD9Q5K651 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SAMD9Q5K651 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SAMD9Q5K651 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
SAMD9Q5K651 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SAMD9Q5K651 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
SAMD9Q5K651 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
SAMD9Q5K651 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
SAMD9Q5K651 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SAMD9Q5K651 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SAMD9Q5K651 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SAMD9Q5K651 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SAMD9Q5K651 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SAMD9Q5K651 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SAMD9Q5K651 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
SAMD9Q5K651 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SAMD9Q5K651 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SAMD9Q5K651 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SAMD9Q5K651 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SAMD9Q5K651 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SAMD9Q5K651 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SAMD9Q5K651 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SAMD9Q5K651 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SAMD9Q5K651 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SAMD9Q5K651 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SAMD9Q5K651 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
SAMD9Q5K651 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SAMD9Q5K651 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SAMD9Q5K651 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
SAMD9Q5K651 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SAMD9Q5K651 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SAMD9Q5K651 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SAMD9Q5K651 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SAMD9Q5K651 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SAMD9Q5K651 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SAMD9Q5K651 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SAMD9Q5K651 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SAMD9Q5K651 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SAMD9Q5K651 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SAMD9Q5K651 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SAMD9Q5K651 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SAMD9Q5K651 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SAMD9Q5K651 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SAMD9Q5K651 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SAMD9Q5K651 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SAMD9Q5K651 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
SAMD9Q5K651 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
SAMD9Q5K651 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
SAMD9Q5K651 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SAMD9Q5K651 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SAMD9Q5K651 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
SAMD9Q5K651 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SAMD9Q5K651 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
SAMD9Q5K651 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SAMD9Q5K651 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
SAMD9Q5K651 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SAMD9Q5K651 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SAMD9Q5K651 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
SAMD9Q5K651 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SAMD9Q5K651 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SAMD9Q5K651 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SAMD9Q5K651 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SAMD9Q5K651 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SAMD9Q5K651 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SAMD9Q5K651 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SAMD9Q5K651 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SAMD9Q5K651 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SAMD9Q5K651 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SAMD9Q5K651 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SAMD9Q5K651 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SAMD9Q5K651 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SAMD9Q5K651 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SAMD9Q5K651 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SAMD9Q5K651 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SAMD9Q5K651 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SAMD9Q5K651 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SAMD9Q5K651 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SAMD9Q5K651 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
SAMD9Q5K651 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SAMD9Q5K651 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SAMD9Q5K651 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SAMD9Q5K651 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SAMD9Q5K651 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SAMD9Q5K651 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SAMD9Q5K651 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SAMD9Q5K651 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SAMD9Q5K651 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SAMD9Q5K651 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SAMD9Q5K651 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms